巧家县地处滇、川两省腹心地带，位于云南省东北部、昭通市西南部，地理坐标界于东经102°52′~103°26′，北纬26°32′~27°25′之间。东与曲靖市会泽县接壤，南与昆明市东川区毗邻，西与四川省凉山州会东、宁南、布拖、金阳等县隔江（金沙江）相望，北与昭通市昭阳区、鲁甸县隔江（牛栏江）相望。县境东西宽约57Km，南北长约98Km，辖17个乡镇（街道）、192个村（社区），国土总面积3245平方公里，总人口62.5万人，是昭通市面积、人口第三大县。巧家县人民政府驻地白鹤滩镇，是巧家县政治、文化，枢纽中心，距离省会昆明268公里，昭通151公里，四川西昌169公里。

基本县情概括为“历史悠久、人文荟萃、区位独特、气候宜居、资源富集”。其中，生物资源富集，主要集中在药山国家级自然保护区，属森林生态系统类型的自然保护区，保护面积20141公顷，其中核心区8033公顷、缓冲区7211公顷、实验区4897公顷，由药山和杨家湾两个独立片区组成。保护区植被有常绿阔叶林、硬叶常绿阔叶林、落叶阔叶林、暖性针叶林、温性针叶林、干热稀树灌草丛、灌丛、草甸8个植被，其中原生植被类型、濒危物种构成的群落、冰川遗迹上发育的沼泽化草甸三类植被需重点保护。保护区有维管束植物191科、680属、1406种，其中有杜仲属、珙桐属、巴山木竹等13个中国特有属，有攀枝花苏铁等约20 种中国西南特有种，有巧家五针松等10种药山自然保护区特有物种。有保护植物52种，其中国家级保护植物46种，省级保护植物6种；有陆栖脊椎动物262种，其中两栖类动物13种，爬行动物20种，鸟类164种，兽类65种，其中国家级保护野生动物31种（国家一级保护野生动物4种，国家二级保护野生动物27种）。药用植物（含菌物）850余种。保护区主要地质遗迹有燕山期至喜山期中晚阶段的古夷平面、第四纪冰期遗迹、深切河谷、西南地区奥陶系单位巧家组。